Arbeitsgemeinschaften bieten die Möglichkeit jahrgangsübergreifend mit anderen gemeinsam etwas zu unternehmen oder zu gestalten.  Zum Schuljahresbeginn wählen die Kinder und Jugendlichen der Jahrgangsstufen 5 – 8 je nach Interesse eine AG aus dem vielfältigen Angebot. Zum Halbjahr wird erneut gewählt, lediglich die Theater-AG und die Big Band-AG sind aufgrund der Auftritte für ein Jahr bindend.

Die Arbeitsgemeinschaften der Mittelstufe bieten Schülerinnen und Schülern die Möglichkeit, sich gezielt weiter zu qualifizieren. Ein Beispiel hierfür ist das ICDL-Zertifikat. Das Laurentianum ist ein anerkanntes Zertifizierungszentrum für den Europäischen Computerführerschein.

Neben den Musik-AGs kooperiert das Laurentianum mit der Schule für Musik in Warendorf, so dass während der AG-Zeit in der Schule ein Instrument erlernt werden kann.